Với thân hình nhỏ bé, Harry Potter với chiếc mũi dài và đôi tai lừa đặc trưng. Dobby mang tới những lời cảnh báo về các nguy hiểm đang chờ Harry và tìm mọi cách để ép Harry nghỉ học, khiến cậu bị khóa trong phòng trên lầu.
Tuy nhiên Harry đã bỏ qua những lo lắng và sợ hãi để quay trở lại trường nhờ sự giúp đỡ của người bạn thân Ron Weasley. Tại đây, hành trình giải cứu em giá Ginny Weasley bị bắt vào phòng chứa bí mật được bắt đầu. Tuy nhiên hàng loạt sự kiện khác cũng đồng thời diễn ra như vết máu lạ trên tường, học sinh các nhà hóa đá, câu chuyện rùng rợn về phòng chứa bí mật, hay những giọng nói lạ từ bên kia bức tường.
Để tìm cách cứu em gái, Ron và Harry đã tìm được lối vào phòng chứa nhưng bị thầy Lockhart tấn công. Lockhart bị mất trí nhớ và lối vào phòng bí mật cũng bị phá, chỉ mình Harry mới có thể đến được phòng chứa bí mật.
Tại đây, Harry phải cứu Ginny khỏi sự kiểm soát của Voldermort. Kịch tính được đẩy lên cao trào khi Harry chạm trán tử xà Basilisk, con quái vật canh giữ phòng chứa bí mật theo lệnh của Tom Riddle. May mắn thay, nhờ sự trợ giúp của con phượng hoàng Fawkes Harry đã giết được Basilisk bằng thanh gươm Gryfindor và phá hủy Tom Riddle bằng chiếc răng của con mãng xà sau khi đâm vào tay qua cuốn nhật ký chết người mà Lucius Malfoy đã cố tình bỏ vào cặp của Ginny trước đó..